Hầu hết phân loại hiện nay[2] công nhận ba phân ngành (Pucciniomycotina, Ustilaginomycotina, Agaricomycotina) và hai đơn vị phân loại khác thuộc cấp lớp (Wallemiomycetes, Entorrhizomycetes) nằm ngoài 3 phân ngành trên. Các phân ngành như định nghĩa hiện nay là sự gộp lại cũng như cắt bớt nhiều đơn vị phân loại đã lỗi thời (xem dưới đây) mà trước đây được dùng để mô tả Basidiomycota. Theo một ước lượng năm 2008, Basidiomycota gồm ba phân ngành, 16 lớp (trong đó có 6 lớp không xác định), 52 bộ, 177 họ, 1.589 chi, và 31.515 loài.[3]

Theo truyền thống, Basidiomycota được chia làm 2 lớp, nay không dùng nữa:

• Homobasidiomycetes bao gồm các loài nấm lớn thực sự.
• Heterobasidiomycetes.